Ahlquist har varit chefredaktör för tidningen sedan 2009 och är en av dess grundare.
”Jag har varit med i ledningen för Fokus ända sedan starten för tio år sedan och nu känner jag att det är dags för någon annan att ta över”, säger han i ett pressmeddelande.
Vad han kommer göra framöver vet han ännu inte:
– I tio års tid har jag tänkt på vad som är bäst för Fokus framtid. Det kommer att ta en stund för mig att ställa om och kunna tänka på vad som är bäst för mig, säger han till Dagens Media.
Ett arbete har nu inletts för att hitta Ahlquists efterträdare. Redaktionschef Anna Körnung tar över som tillförordnad chefredaktör tills en ny är på plats.