Flera tåg ställdes in sedan 17-tiden på torsdagseftermiddagen och ersättningsbussar sattes in.
– Spårfelet berodde på att det skavde mellan den gamla och nya rälsen efter ett pågående banarbete, säger Per Aronsson, presskommunikatör vid Trafikverket.
Öresundståget, som tidigare under kvällen fick vända i Ronneby, kör nu med nedsatt hastighet ut från Karlskrona och det kommer bli fem–tio minuters förseningar fram till klockan 06 på fredagsmorgonen.
Även Krösatåget var inställt mellan Karlskrona och Emmaboda.