Avlivningen var mycket hastig och det fanns enligt rätten inget uppsåt att orsaka musen lidande, skriver lokala medier.
Åklagare Anna Beckman kommer att överklaga domen till Svea hovrätt.
Hennes vittne, länsveterinär Torsten Jacobsson, framhöll att mannen fick slita och dra för att få av huvudet och att musen dog en skräckfylld död.