De döda är en 12-årig pojke och en kvinna, meddelar borgmästarkontoret i den rebellkontrollerade staden. Attacken ägde rum på torsdagseftermiddagen.
En raket träffade taket till sjukhuset och en annan slog ner på en parkeringsplats. Ingen skadades i attacken mot sjukhuset, skriver nyhetsbyrån AP.
Den vapenvila som båda parter enades om i september har brutits vid upprepade tillfällen sedan den undertecknades.
Den blodiga konflikten har krävt fler än 4300 människors liv sedan mitten av april, enligt FN.