Det uppger människorättsorganisationen Human Rights Watch (HRW) i en rapport. Barnen är ibland bara åtta år när de tvingas ut i arbete på odlingarna.
Enligt HRW tvingas de hantera giftiga kemikalier, använda sylvassa verktyg och bli exponerade för nikotin i extrem hetta.
Det finns cirka 500.000 tobaksodlingar i Indonesien, som är världens femte tobaksproducent.
HRW slår fast att det förekommer barnarbete vid tobaksodlingar i fyra indonesiska provinser.Tre av dessa står tillsammans för närmare 90 procent av landets totala tobaksproduktion: östra Java, centrala Java och Nusa Tenggara Barat.
I landet opererar dotterbolag till världens två största tobaksjättar – British American Tobacco och Philip Morris International.