Unga demonstranter har kastat sten och flaskor mot polisen, och minst sju poliser ska ha skadats. Butiker har också plundrats och satts i brand.
Vita huset uppger att president Barack Obama har informerats om händelserna i Baltimore och att justitiedepartementet är redo att erbjuda hjälp.
Freddie Gray, som var 25 år, dog för en vecka sedan i sviterna av en ryggskada, som han fick efter att ha gripits. Sex poliser, som var inblandade i händelsen, har stängts av från sitt jobb.
Gray var svart och händelsen kopplas till rasism inom poliskåren.
Det har under veckan hållits flera fredliga demonstrationer i Baltimore mot polisbrutalitet, men i lördags blev det våldsamma sammanstötningar med 35 gripna.
På University of Maryland, som ligger i Baltimore, stängde man av säkerhetsskäl inför begravningen på måndagen. Även butiker och krogar i stadskärnan har stängts.