Pojken fördes med ambulans från hemortssjukhuset direkt till barnintensivvårdsavdelningen på SUS i Lund.
Hela händelseförloppet från den 3e juli ska nu granskas efter att en anmälan gjorts till IVO.
– Detta är en mycket tragisk händelse som vi djupt beklagar och tar på största allvar, säger Elisabeth Olhager, verksamhetschef för barnkirurgi och neonatalvård på SUS.
Utredningen omfattar hela händelseförloppet, från att läkare på SUS kontaktades och pojken anlände med ambulans till barnintensivvårdsavdelningen, till omhändertagandet på sjukhuset och hur medarbetare agerat efter det tragiska dödsfallet.
– Utredningen kommer att fullföljas och innan den är klar kan vi inte säga mer om omständigheterna i fallet, säger Elisabeth Olhager, i ett pressmeddelande.