Det var terrororganisationen Islamiska staten som dödade uppemot 1.700 soldater på Camp Speicher medan de avancerade i norra Irak, rapporterar BBC.
– Avrättningen av de 36 dömda verkställdes i morse i Nasiriyah-fängelset, sade en talesman för guvernören i provinsen Dhiqar.
Justitieministern Haidar al-Zamili medverkade vid avrättningarna, uppger en talesman för fängelset.
De avrättade tros alla ha varit irakiska medborgare. De dömdes till döden i februari.
Hittade massgrav
De flesta av de dödade soldaterna var shia-rekryter, och den kraftiga reaktionen på massakern hjälpte Irak att mobilisera shiamilis i kampen mot IS. IS publicerade bilder och filmklipp som visar hur soldater fördes bort på fordon och tvingades ligga ned med ansiktet i marken innan de sköts till döds.
En massgrav med offren hittades 2015, när regeringsstyrkor återtog IS-kontrollerade områden.
Reaktion på Bagdadattack
Premiärminister Haider al-Abadi lovade efter Bagdad-attacken i förra månaden, då hundratals dödades, att avrättningar av terrordömda ska skyndas på.
President Fuad Masum ratificerade avrättningarna i förra veckan.
Totalt har 40 jihadister dömts till döden för dådet i Camp Speicher. Fyra avrättningar genomfördes tidigare i år, skriver Al-Masdar News.