Förutom de 44 som är anhållna prövas tre personer i sin frånvaro under rättegången i staden Mugla. Erdogan, som semestrade på ett lyxhotell i Marmaris med sin familj när kuppförsöket inleddes, har hävdat att han var en kvart från döden. Bland de misstänkta finns 37 soldater som anklagas för att ha utgjort en grupp med uppdrag att mörda presidenten.
I en intervju har Erdogan sagt att det var hans tro som hjälpte honom och hans familj att fly oskadda.
Över 40.000 personer har gripits efter kuppförsöket, många pekas ut som anhängare till predikanten Fethullah Gülen, som Ankara anklagar för att ligga bakom kuppförsöket.