Israel svarade med artilleri riktat mot den position raketerna avfyrades från i Syrien, uppger en talesperson för den israeliska militären. Man har även beordrat att skidorten Mount Hermon i Golanhöjderna ska evakueras.
Det fanns på tisdagseftermiddagen inga uppgifter om skadade och ingen har tagit på sig attacken.
Utlovat hämnd efter israelisk flygattack
Attacken kommer en knapp vecka efter att israeliska luftstyrkor beskjutit en Hizbollah-konvoj nära Golanhöjderna. Sex milismän från den shiamuslimska rörelsen dödades, enligt uppgifterna ska en av de dödade vara son till den tidigare militäre ledaren Imad Mughniyah.
Både Hizbollah, som stöds av Iran och stred i 34 dagar mot Israel 2006, och det iranska revolutionsgardet har lovat att hämnas offren.
Israel erövrade större delen av Golanhöjderna från Syrien i sexdagarskriget 1967, och ockuperar fortfarande dessa områden.