Kraschen skedde vid en tågstation då tåget inte stannade för en stoppbock som stod på spåret, meddelade New Yorks guvernör Andrew Cuomo vid en presskonferens.
En passagerare berättar för ABC News att hon hörde en stor smäll. Därefter följde en tumultartad situation med skrikande och gråtande passagerare som föll över varandra.
Ett stort antal ambulanser skickades till olycksplatsen och bilder visar hur skadade bärs i väg på bårar.
Enligt Andrew Cuomo ska tåget dock ha färdats i ”relativt låg fart” och den värsta skadan bland de 103 skadade tycks vara en brutet ben.
Anledningen till att tåget inte stannade i tid ska nu utredas.
Ungefär 600 personer ska ha befunnit sig ombord på tåget när det kraschade vid halv niotiden lokaltid, enligt ABC News.