Beskjutningen skedde nära staden Manbij i Aleppoprovinsen, ett område som kontrolleras av USA-allierad, kurdisk YPG-milis. YPG-krigarna ska inte ha uppmärksammat en varning från de turkiska styrkorna, rapporterar CNN Turk.
De turkiska trupperna har nyligen gjort sitt intåg i Syrien, med syfte att driva bort IS men även hindra att kurderna tar över området när jihadisterna drar sig tillbaka.
Turkiets president Recep Tayyip Erdogan sade på onsdagen att både YPG och IS är att betrakta som terrororganisationer.