Segern är närmast given för den förre arméchefen Abd al-Fattah al-Sisi, som i praktiken varit landets ledare sedan Mohammad Mursi störtades av militären i somras.
al-Sisis enda utmanare är vänsterpolitikern och poeten Hamdin Sabbahi som kom trea för två år sedan. Då segrade Muslimska brödraskapets kandidat Mursi, i det första fria presidentvalet i Egyptens historia.
Men han avsattes efter ett år, efter konfrontation med rättsväsendet och omfattande folkliga protester.
Sedan dess har Muslimska brödraskapet terrorstämplats och över 1.400 människor dödats i våldsamma sammandrabbningar med säkerhetsstyrkor.