Kommentaren riktades mot utbildningsminister Jevgeni Ossinovski, som är socialdemokrat och den enda ministern från landets rysktalande minoritet.
Efter en het tv-debatt i onsdags kallade Ligi sin ministerkollega Ossinovski för ”en invandrares son från ett ljusrött parti”, vilket fördömdes av bland andra president Toomas Hendrik Ilves.
Rysktalande utgör en dryg fjärdedel av landets invånare, men har inte fått medborgarskap på samma villkor som esterna efter självständigheten 1991. För att bli estnisk medborgare måste man bland annat klara av ett språktest, vilket kritiserats bland annat av FN.