Påve Franciskus säger att rättsfallet åsamkat honom ”mycket stor smärta”.
– Men sanningen är sanningen och vi ska inte dölja den, sade påven på onsdagen.
Tre präster och en teologilärare greps i måndags sedan en 24-årig man i ett brev till Vatikanen anklagade präster för att ha ofredat honom som pojke, och även flera andra barn.
Nu har ytterligare en man, kamrat med den förste, anmält prästerna för övergrepp under hans tid som altarpojke.
Franciskus säger att han själv ringde upp mannen som skrev brevet, bad om ursäkt å kyrkans vägnar och bad honom vända sig till Granadas ärkebiskop.
Därefter kontaktade påven ärkebiskopen och bad honom inleda en utredning.