Ordern kom från Rysslands president Vladimit Putin i förmiddags. Stridsberedskapen för 150.000 soldater, 880 stridsvagnar, 90 flygplan och 80 fartyg ska testas under den kommande veckan.
Övningarna kommer främst hållas vid landets västra gränser.
Försvarsminister Sergej Sjojgu hävdar att ordern inte har med utvecklingen i grannlandet Ukraina att göra, men Ryssland har varit märkbart upprört över händelserna där.
Nära band
Ukrainas Rysslandsstödde president Viktor Janukovytj och hans regering tvingades bort från makten i helgen efter månader av massprotester runt om i landet.
Ryska UD uttrycker nu oro för vad man anser vara en ökande nationalism i Ukraina, som man ser som ett hot mot Ukrainas rysktalande befolkning.
Den ryska svartahavsflottan har också sin bas på den oroliga ukrainska Krimhalvön, som har en ryskspråkig majoritetsbefolkning.
– Vi vidtar åtgärder för att säkerställa säkerheten för Svartahavsflottans anläggningar, infrastruktur och arsenaler, sa försvarsminister Sjojgu enligt ryska medier.
Politiker lugnar
Retoriken har lett till frågor om huruvida Ryssland överväger en militär intervention i Ukraina. Detta förnekas dock i Moskva.
– Det är ett omöjligt scenario, säger Valentina Matvijenko, talman för det ryska parlamentets överhus.
Hon utesluter också möjligheten att dela ut ryska pass till etniska ryssar i Ukraina, ett drag som föregick den ryska inmarschen i två georgiska separatistrepubliker 2008.