En roligare födelsedagspresent kunde den nyblivne 27-åringen ha tänkt sig.
– Det är givetvis en besvikelse både för honom och för oss, säger Löw.
Prognoserna är bättre för Bastian Schweinsteiger, Manchester United, och Mats Hummels, Borussia Dortmund, som båda trots skadeproblem åker med till Frankrike.
Tyskland möter Ukraina i EM-premiären den 12 juni.
Deadline day för EM-trupperna
Före midnatt måste samtliga EM-trupper vara presenterade.