Hellner, sprintvärldsmästare i Holmenkollen 2011, var drygt tio sekunder långsammare än kvalsegraren Sergej Ustjugov, Ryssland.
– Jag tyckte det kändes helt okej. Jag var inte stum eller så, jag var inte tillräckligt snabb helt enkelt. Snabbheten finns inte där just nu, finns inget annat att konstatera, sade Hellner till SVT.
Simon Persson hade nionde bästa tid och gick vidare till kvartsfinal. Där får han sällskap av Johan Edin, Martin Bergström, Anton Lindblad och Teodor Peterson.