Museet ska kasta ljus på landets kontroversiella roll under andra världskriget. Rumänien nekade länge till all inblandning i Förintelsen och gick först 2003 med på att låta experter utreda landets roll under kriget.
Utredningen kom fram till att 280 000 rumänska judar och 380 000 ukrainska judar dog i Rumänien under andra världskriget.
– De rumänska judarnas historia, deras bidrag till landets utveckling och tragedin de upplevde under kriget, representerar ett arv som har hållits dolt för oss i decennier, sade president Klaus Iohannis under en ceremoni på tisdagen, enligt AFP.