Skolinspektionen skriver att högstadieelevens frånvaro uppgick till upp emot 56 procent under höstterminen 2017 på grund av återkommande sjukdom.
I ett svar till tillsynsmyndigheten skriver skolan att eleven fått stöd, bland annat i from av eget studierum och att en plan för studiehjälp upprättats.
Men eftersom eleven även varit borta mycket terminen innan menar Skolinspektionen att skolan inte utrett bakgrunden till den höga frånvaron i tillräcklig utsträckning.
Tillsynsmyndigheten skriver också att att skolan borde genomfört särskilda stödåtgärder för att öka elevens närvaro.
Jönköpings kommun har nu på sig till den 28 maj att åtgärda bristerna.