Enligt Trafikverket har ett tåg kört på en sten på sträckan mellan Vagnhärad och Hölö.
– Nu ska vi syna av sträckan och efter det kommer vi kunna köra igen, säger Lii Hylander, presskommunikatör.
Strax efter klockan 08 meddelade Trafikverket att felet var åtgärdat och att tågen går som vanligt igen.
Stationer som kan ha påverkats är Nyköping C och Vagnhärad.