Facebook har 1,6 miljarder användare runt om i världen och tjänar i första hand pengar på riktade annonser till användarna, som bygger på information om användarnas vänner, åsikter och aktiviteter.
– Vi är övertygade om att vi följer lagen och vi ser fram emot att jobba ihop med den tyska konkurrensmyndigheten för att ge svar på deras frågor, säger en talesperson för Facebook.
Facebookgrundaren Mark Zuckerberg besökte Berlin så sent som i förra veckan och lyfte då fram det sociala nätverkets arbete för integritetsskydd och mot näthat.
Inför besöket hade Facebook fått kritik för hur man hanterat nynazistiska uttalanden på nätverket.