Militärerna anklagas för inblandning i kuppförsöket 2016 mot den turkiske presidenten Recep Tayyip Erdogan.
De flydde till Grekland i en helikopter den 16 juli.
Det är tredje gången en grekisk domstol avslår en turkisk begäran om att utlämna dem – ett ärende som lett till ökade spänningar mellan de båda Nato-allierade länderna.