59-årige Astiz, en före detta marinofficer som även kallats Den blonde dödsängeln, har tidigare i sin frånvaro fällts i Frankrike för mord på två nunnor under den argentinska militärdiktaturen 1976-1983.
Ytterligare elva före detta militärer och poliser dömdes samtidigt som Astiz till livstidsstraff för brott mot mänskligheten, rapporterar BBC.
Domarna mot Astiz och de andra hälsades med applåder av hundratals människor som samlats utanför domstolen, rapporterar Reuters.
Många hade med sig fotografier på några av de tusentals offren för den forna militärjuntans ”smutsiga krig” mot vänsteraktivister.
-Äntligen kan vi få frid när vi vet att rättvisa har skipats, sade en av kvinnorna vid domstolen.
Knuffades ut från flygplan
Utöver de tolv livstidsdomarna dömdes ytterligare fyra personer till mellan 18 och 25 års fängelse.
Rättegången har gällt brott som begicks på Esma – den argentinska marinens tekniska skola – som var ökänd som en av juntans förhörscentraler där tusentals människor blev torterade.
Många av dem dödades sedan genom att knuffas ut från flygplan på hög höjd över havet.
Fallet med Dagmar Hagelin har dock inte ingått i rättegången. Den då 17-åriga svenskan greps i januari 1977 när hon skulle hälsa på en väninna.
När hon kom till platsen möttes hon av en kommandogrupp som kvällen innan hade gripit väninnan, utan Hagelins vetskap.
När svenskan försökte springa iväg sköts hon av Astiz och fördes bort svårt skadad. Hennes slutliga öde är fortfarande oklart.
TT