Puigdemont ställdes under måndagseftermiddagen inför en regional domstol i staden Neumünster i den tyska delstaten Schleswig-Holstein.
Efteråt mötte den tyske åklagaren upp pressuppbådet som samlats utanför och gav besked: Puigdemont kommer att hållas frihetsberövad fram tills dess att ytterligare en rättsinstans i staden beslutat huruvida han ska utlämnas till Spanien eller inte.
Det är ett beslut som troligen dröjer till efter påsk, enligt en talesperson vid domstolen.
Protester efter gripandet
Gripandet av den katalanske ex-presidenten har väckt omfattande protester i Katalonien. Totalt skadades omkring 100 personer, varav 23 poliser, under protester på söndagskvällen runt om i regionen. Nio personer har gripits, enligt myndigheterna.
Puigdemont gick i landsflykt i Belgien i början av november. Han riskerar upp till 25 års fängelse för uppror och andra brott efter höstens otillåtna folkomröstning och självständighetsförklaring för Katalonien.
I fredags återaktiverade domaren Pablo Llarena i Spaniens högsta domstol den europeiska arresteringsordern för Puigdemont. Och på söndagsförmiddagen stoppade tysk polis en bil vid orten Schuby, cirka tre mil från tysk-danska gränsen. I fordonet fanns Puigdemont och fyra personer.
Riskerar 25 års fängelse
Sällskapet var på väg till Belgien, skrev Puigdemonts advokat Jaume Alonso-Cuevillas på Twitter. Före frihetsberövandet i Tyskland rapporterades att Puigdemont befunnit sig i Finland.
Puigdemont är tillsammans med 24 andra katalanska separatister sen mars åtalad misstänkt för uppror och andra brott relaterade till höstens olagliga folkomröstning och självständighetsförklaring i Katalonien. Som mest riskerar de fängelse i 25 år.