Tisdagens beslut bygger på en kompromiss från i december mellan medlemsstaterna och EU-parlamentets förhandlare och röstades formellt igenom med 480 parlamentsröster mot 159.
De nya reglerna ger varje medlemsstat utökad rätt att stoppa en GMO-gröda, även om den godkänts centralt på EU-nivå.
”En stoppsignal för innovation i Europa”, tycker branschorganisationen Europa Bio i ett besviket uttalande, samtidigt som miljörörelsen befarar att reglerna ska öppna upp för fler tillstånd.
Missnöjda är också EU-parlamentarikerna Anna Maria Corazza Bildt (M) och Malin Björk (V).
– Jag röstade mot den kompromiss som uppnåtts med rådet för att jag anser att reglerna måste baseras på vetenskap och fakta och inte allmänt tyckande, säger Anna Maria Corazza Bildt (M)
– Jag röstade emot förslaget. Det var en blixtuppgörelse, istället för att låta folket säger säga sitt, säger Malin Björk (V).
Se Per Malms intervju med EU-parlamentarikerna Anna Maria Corazza Bildt (M) och Malin Björk (V) i klippet ovan.