Det är första gången som F-22 – ett tekniskt mycket avancerat ”smygflygplan” som är väldigt svår att upptäcka med radar – landar på före detta sovjetiskt territorium.
Enligt Alar Laats, talesperson för det estniska flygvapnet, var träning av olika förmågor orsak till besöket. Han uppgav också att planen återvände till sina baser i Tyskland efter några timmar.
Luftrummet över de tre baltiska länderna – alla medlemmar av Nato – övervakas enligt ett rullande schema av stridsflygplan från andra Nato-länder.
I måndags besökte två F-22 också Polen.
Efter Ryssland annektering av Krim-halvön och de efterföljande striderna i östra Ukraina har säkerhetsläget i östra Europa försämrats radikalt.