Strider uppges rasa mellan islamister och militär.
I Maiduguri, huvudstad i delstaten Borno, har armén sedan en tid sitt högkvarter för kampen mot Boko Haram som på senare tid trappat upp sina attacker.
Nära 200 människor rapporteras ha dödats under två dygns massakrer i Borno, uppger president Muhammadu Buhari som kallar attackerna ”omänskliga och barbariska”.
Det innebär det värsta våldsutbrottet sedan Buhari tillträdde i maj.