Enligt påvens talesperson hade omkring en halv miljon människor samlats för att välkomna Franciskus.
På flygplatsen omfamnades påven av president Rafael Correa och innan de färdades vidare genom staden ska beundrare fått en chans att ta selfies tillsammans med Franciskus.
Under besöken i Ecuador, Bolivia och Paraguay ska påven hålla 22 anföranden. Länderna är övervägande katolska och har präglats av en lång historia av fattigdom och ojämlikhet som främst drabbats ursprungsbefolkningar.
– Framsteg och utveckling måste garantera en bättre framtid för alla, med särskild hänsyn till våra mest sårbara bröder och de mest utsatta minoriteterna, sade påven i Quito.