Flyktingarna kommer i huvudsak från krigens Irak, Syrien och Afghanistan.
Omkring 50.000 personer har kommit till Ungern bara i augusti. De har fått ta tåget till Österrike och Tyskland tills i går då polisen började kräva EU-visum för att bli insläppt på stationen.
Ungerns högerregering säger att man nu tillämpar EU:s regelverk när migranterna stoppas.
Tusentals korsade gränsen
Ungern har också byggt ett taggtrådsstängsel längs gränsen till Serbien som hittills inte har haft avsedd effekt. Enbart i går korsade 2.284 människor gränsen, varav 353 barn.
– Om Europa släpper in oss, varför får vi inte visum? sade Bilal från Syrien.
Enligt honom befarar migranterna att Tyskland ska stänga sin gräns och skyndar sig dig därför.