Läckan, som avslöjats av det nederländska tv-programmet Zembla, ska ha inträffat när en anställd laddade över uppgifterna till en privat hårddisk.
– Nuvarande information tyder på att händelsen inte var illa menad, förklarar Europol-talesmannen Gerald Hesztera för AFP.
Även om uppgifterna sägs vara omkring tio år gamla och den anställda redan hunnit lämna Europol har händelsen väckt en hel del upprördhet.
I EU-parlamentet kräver den liberala partigruppen Alde att Europolchefen Rob Wainwright dyker upp för att förklara sig.
”Det här är extremt chockerande. Europol har känt till den här säkerhetsincidenten sedan i september och ändå underlät dess chef att informera parlamentet under ett gemensamt möte för bara två dagar sedan”, säger Alde-ledamoten Sophie in't Veld i ett uttalande.