13 personer greps i operationen som omfattade 900 poliser i städerna Wien, Graz och Linz.
Polisen har i två år undersökt ett antal personer som är misstänkta för att värva ungdomar till krigets Syrien. En bosnisk predikant uppgavs vara en av de misstänkta, enligt österrikiska medier.
Polisen beslagtog också ”terroristpropaganda”, dokument och pengar.
Omkring 150 personer bosatta i Österrike har åkt till Syrien och Irak för att ansluta sig till väpnade islamiströrelser.