Flickorna som är mellan 12 och 14 år gamla, kidnappades under knivhot från ett elevhem på den kristna skolan i Pakur-distriktet, medan skolpersonalen låstes in i ett rum.
Flickorna släpades till ett närliggande skogsområde där de våldtogs, vilket läkarundersökningar bekräftat.
De misstänkta männen hör till lokalbefolkningen, enligt polischefen.