Det svenska OS-hoppet, som var tvåa på den första etappen, tappade därmed tätkänningen och är hela 1.02 bakom ledande Megan Guarnier, USA.
Hemmanationen dominerar och har sex cyklister i topp. Guarnier leder med tolv sekunder före Kristin Armstrong.
Tävlingen avgörs över fyra etapper och går i mål på söndag.