Tokyobörsens Nikkei 225-index sjönk med 1,6 procent medan det bredare Topixindex backade med 1,3 procent.
I Taiwan stängde börsen på minus 1,3 procent och Kospi-indexi i Seoul stängde på minus 0,6 procent.
Vid åtta-tiden på morgonen låg Shanghais kompositindex strax under nollstrecket och i Hongkong hade Hang Seng-index gått ner med runt 2 procent.
Enligt den statliga nyhetsbyrån Nya Kina var onsdagens sänkning av riktkursen för yuanen 1,62 procent mot USA-dollarn. Valutan sjönk till sin lägsta nivå mot dollarn på fyra år.
Dagen innan sänktes värdet med 2 procent.