Pojkarna har förts till sjukus med ambulans, men ska inte ha fått allvarliga skador.
– De är vakna och talbara, säger Helena Bostrom Thomas, vid Stockholmspolisen.
Polisen utreder händelsen som vårdslöshet i trafik, olovlig körning och vållande till kroppsskada.
Efter olyckan har Färentunavägen stängts av i ena riktningen.