Det uppdagades när Östersundsposten begärde ut e-postkorrespondensen. Bara åtta av 35 mejl lämnas ut.
Kommunen menar att e-posten inte är offentliga handlingar och därför inte har sparats.
Efter avslöjandet om att flyktingbarn erbjudits svartjobb har Krokoms kommun tillsatt en utredning. Enligt plan ska den vara klar på fredag.