Larmet om branden kom in till SOS Alarm strax innan klockan åtta på fredagskvällen. Det var privatpersoner som upptäckte branden.
– Det finns ingen spridningsrisk, säger Klas Löfgren, räddningstjänstens inre befäl i Jönköping till SVT vid 20.30.
Enligt räddningstjänsten förvaras verktyg i containern och den tillhör det bolag som bygger de nya husen i Munksjöstaden.
Containern ska vara stängd. Vad som orsakat branden är för tidigt att säga.