Företaget ska bygga ett nytt kontor i Svågertorp, i anslutning till det nya varuhuset.
Inom fyra år beräknas flytten ske.
De anställda erbjuds att följa med.
– Malmö ligger bättre till för våra globala tjänster, bland annat på grund av infrastruktur och närheten till Svågertorp, säger Peter Agnefjäll, vd för Ikea Svenska Försäljnings AB.
Ikea kommer inte att lämna Helsingborg.
Ledningen blir kvar liksom det nybyggda Ikeavaruhuset på Väla. Kvar i Helsingborg blir även Ikea IT och ett bolag inom Inter Ikea-gruppen som äger Ikeas varumärke.