Larmet om drunkningstillbudet kom klockan 15.54 på tordagseftermiddagen. Ambulans, räddningstjänst och polis skickades till platsen.
Det drabbade barnet fick akutsjukvård på platsen och fördes med ambulans till sjukhuset. Ambulansen fick poliseskort till sjukhuset.
Strax efter klockan 18 meddelade polisen att pojken avlidit. Pojkens anhöriga har underrättats.
Avspärrat på Segebadet
Polisen har valt att spärra av ett område inne på badet.
– Vi fotograferar och filmar för att kunna skapa en bild av vad som hänt. Vi håller också förhör kontinuerligt. Det är en varm och solig dag i Malmö och det är mycket folk som har sett det här, säger Richard Lundqvist, presstalesperson vid polisen i Region Syd.
Händelsen rubriceras som vållande till annans död.