Stoppet påverkade bland annat tågtrafiken på sträckorna Stockholm–Malmö och Stockholm–Göteborg. Även andra sträckor påverkades, bland annat Mälartåg mot Uppsala och tåg till Gävle.
En del tåg leddes om, enligt Trafikverket.
Larmet om händelsen kom vid 15.50 på torsdagen.
– En lokförare meddelade att han eventuellt kört på något eller någon ute vid Grödinge, sade polisens presstalesperson Daniel Wikdahl, till SVT.
– Vi har varit ute och sökt på spåret och i en tunnel, även med helikopter. Men vi har inte hittat något. Så nu har i alla fall polisen hävt sitt tågstopp, sade Wikdahl vid 18-tiden.
Strax efteråt hävdes också tågstoppet av Trafikverket. Förseningar kan dock fortsätta under torsdagskvällen.