Larmet kom 02.33. Polisen har lokaliserat explosionerna till ett flerbostadshus i Kista och ett i Husby. Det är några hundra meter mellan husen.
Explosionen i Husby beskrivs som den kraftigaste med omfattande skador. Enligt vittnen ligger både plåt och glassplitter på marken, och 10-20 fönsterrutor har krossats.
Polisen har också evakuerat människor från en av fastigheterna för att kontrollera skadornas omfattning. Polisen uppskattar att det rör sig om cirka femtio personer.
Polisens tekniker och nationella bombskyddet har kallats in för att undersöka lägenheterna. Polisen har spärrat av platsen och arbetar med att samla in information om vad som kan ha hänt.