Beslutet är en följd oroligheterna på läktarna i samband med mötet med Marseille i början av oktober. Om det blir fortsatta läktarproblem kan straffet utökas till ytterligare en hemmamatch.
Atléticos nästa hemmamatch i Champions League spelas mot Liverpool, men det blir alltså inget återvändande till Vicente Calderón-stadion för Fernando Torres.
Utöver de flyttade matcherna har Uefa beslutat att den spanska klubben ska betala 150 000 euro i böter.
Coachen avstängd
Det var inte bara publiken som betedde sig illa. Atléticos coach Javier Aguirre stängs av två matcher på grund av sitt olämpliga beteende under matchen.
Aguirre får inte kommunicera med eller vara nära sitt lag i de kommande mötena med Liverpool.
Mirja Hjelmberg