Efter en mållös första halvlek smällde det fyra gånger om i den andra. Bayern München tog ledningen i den 57:e minuten efter ett självmål av en Ajaxspelare.
Drygt tio minuter senare kom också 2-0 genom Sydney Lohmann.
Ajax reducerade med tio minuter kvar men gästerna fick sista ordet. I den 86:e minuten satte Simone Laudehr 3-1 vilket blev slutresultatet.
Bayern München har därmed ett utmärkt utgångsläge inför returen på hemmaplan den 16 december.
Svenska landslagsduon Amanda Ilestedt och Hanna Glas spelade från start för Bayern München. Glas spelade hela matchen medan Ilestedt blev utbytt i paus.
KLIPP: Rosengårds kross i Champions League (9 december 2020)