På sociala medier skriver Alcaraz att skadan uppstod vid en onaturlig rörelse på träning.
”Jag har jobbat så hårt för att nå min bästa nivå inför Australien, men oturligt nog kommer jag inte att kunna spela. Det känns tufft, men jag måste vara optimistisk, se till att bli återställd och se framåt”, skriver han.
Australian Open inleds i Melbourne 16 januari.
Alcaraz vann sin första Grand Slam när han tog hem US Open i höstas, vilket gjorde honom till tidernas yngste världsetta sedan rankingsystemet infördes för 50 år sedan.
Alcaraz missade ATP-slutspelet och Davis Cup beroende en magmuskelskada som han ådrog sig i Paris Masters i början av november.
Javascript är avstängt
Javascript måste vara påslaget för att kunna spela video