Enligt Reuters ska bilen ha texten ”Stoppa globaliseringspolitiken” skrivet på en sidan och ”Ni jävla mördare av barn och äldre” på den andra sidan.
Det finns i nuläget inga uppgifter om skador eller om Merkel var inne i byggnaden vid tidpunkten för händelsen. Polis och brandkår är på plats.
Föraren, en man i övre medelåldern, fördes bort i rullstol.
– Vi undersöker om föraren avsiktligt körde in i grinden, skriver polisen på Twitter.
– Han har tagits i förvar.
Videomöte om nya restriktioner
Angela Merkel ska enligt uppgift på onsdagsmorgonen varit värd för ett videomöte på med tyska delstatsledare för att diskutera ytterligare restriktioner i landet till följd av coronapandemin.
Många europeiska länder är just nu extra vaksamma efter de senaste veckornas terrordåd i Frankrike och i Österrike.
För fyra år sedan körde en man en lastbil rakt in en julmarknad i Berlin. Elva människor dödades och dussintals skadades.