Proverna togs den 2 augusti och svaret som kom på torsdagen visar för höga bakterhalter av e-coli och enterococker i vattnet vid Vikingstrand och Hittarp.
– Det är alltid svårt att säga vad ett enskilt dåligt provresultat beror på, men efter en lång och solig sommar har det den senaste tiden regnat en hel del och då ökar risken för att bakterier hamnar i badvattnet, säger Tomas Terje, områdesförvaltare på stadsbyggnadsförvaltningen i ett pressmeddelande.
Helsingborg stad avråder nu från bad vid de platserna tills proverna visar att vattnet är bra igen.
Resultat på nya prover väntas komma om några dagar.