Enligt Jönköpings-Posten beror krisen på att ett av tre tillfälliga boenden ska rivas och att fyra modulhus blivit försenade eftersom de överklagats, men även den stora bristen på lägenheter i kommunen.
Karl Gudmundsson, socialdirektör, uppger att socialförvaltningen nu larmat politikerna.
– Vi har sagt till politikerna i kommunstyrelsen att vi inte klarar av situationen, säger han till JP.
Enligt tidningen har Migrationsverket anvisat 50 nya flyktingar till Jönköping i augusti och Gudmundsson hoppas nu att kommunen kan få tillfälligt uppskov i mottagandet.
Han uppger att det är lättare för flyktingarna att få jobb än bostad i Jönköping och menar att den generella bostadskrisen i kommunen måste lösas.
Enligt JP tror Karl Gudmundsson att konsekvenserna för flyktingarna kan bli stora om Migrationsverket inte går med på ett uppskov i mottagandet.
Socialförvaltningen har tidigare vädjat till exempelvis privatpersoner om hjälp med rum.
– Det handlar ju om att få tak över huvudet men det finns risk för att människor kan bli bostadslösa under en period, säger han till tidningen.