Föroreningarna i sjön kommer från det gamla pappersbruket och andra intilliggande verksamheter. På botten finns förorenat sjösediment och även en fiberbank av cellulosa från papperstillverkningen.
Men om sjön ska muddras och botten delvis täckas över, kan det kosta upp emot 550 miljoner kronor.
– Munksjön rinner ju ut i Vättern som är en dricksvattentäckt och den måste vi skydda säger Emma Willaredt som är avdelningschef på länsstyrelsen
Det är mycket pengar det handlar om?
– Ja det är det, men att hantera föroreningsproblematik är jättedyrt och svårt och det här är ett särskilt svårt fall.
Företaget som gjort utredningen på uppdrag av Jönköpings kommun har kommit fram till fyra tänkbara åtgärder som skulle förbättra miljön i Munksjön i olika grad. I klippet ovan får du veta mer.