Den 44-årige mannen ska ha spionerat på flera personer i Sverige som uttryckt kritik mot staten Rwanda, som journalister och författare, mellan år 2010 och 2011.
Syftet har enligt åtalet varit att förse företrädare för den rwandiska regimen med information om regimkrikernas personliga förhållanden.
44-åringen ska även ha fått i uppdrag av högt uppsatta militärer i Rwanda att kartlägga regimkritikernas bostadsort, telefonnummer och politiska åsikter.
Enligt åklagaren har 44-åringen fått sina uppdrag från militären via kodade meddelanden.
Åklagaren begär att 44-åringen ska utvisas ur landet.